Estudos realizados durante o levantamento da área do empreendimento apontaram a existência de vestígios de ocupação histórica no local, motivando a realização de um levantamento do potencial arqueológico da região. O trabalho foi baseado em pesquisas documental e oral, realizadas durante percurso pela área diretamente afetada e de entorno, com observações da superfície do terreno. Os vestígios encontrados revelaram restos de estruturas hidráulicas de mineração de ouro no século XVIII, muito comuns nesta região de Minas Gerais, mas ainda pouco conhecidas, além de estradas antigas e estruturas de sustentação, como muros de arrimo. Os vestígios estão localizados principalmente sob a mata ciliar, local que não sofrerá impacto direto do empreendimento.

Todo o trabalho de pesquisa e resgate arqueológico foi autorizado pelo Instituto de Patrimônio Histórico e Artístico Nacional (IPHAN). Como as estruturas encontradas não podem ser retiradas do local de implantação, elas serão resgatadas por meio de fotografias, topografia de detalhes e maquete virtual. Durante a implantação do Vale dos Cristais, as estruturas foram incorporadas ao patrimônio do empreendimento, transformando-se em pontos de visitação onde estão identificadas com placas explicativas.